De kerntaak van het Centrum Rubenianum is de publicatie van het Corpus Rubenianum Ludwig Burchard, de meerdelige oeuvrecatalogus van Rubens. Daarnaast werkt het Centrum sinds 1962 complementair mee aan de kernopdrachten van het Rubenianum, dat de vereniging sinds 1964 huisvest.
Het mecenaatsfonds voor de ondersteuning van het Rubensonderzoek te Antwerpen werd opgericht in 2010.
Twee onderzoeksinstituten werken samen
Sinds 2012 werken het Rubenianum en het RKD – Nederlands Instituut voor Kunstgeschiedenis samen aan de digitale ontsluiting van kunsthistorische documentatie.
Sinds 2014 is het Rubenianum lid van RIHA – International Association of Research Institutes in the History of Art.
Het Overleg Kunstbibliotheken Vlaanderen (OKBV) brengt professionals samen uit Vlaamse en Brusselse bibliotheken die de kunsten documenteren. Het Rubenianum is actief lid van het bestuur sinds de oprichting in 2000 en is vanaf 2015 voorzitter van dit platform.
Voor de ontsluiting van zijn collecties werkt het Rubenianum samen met Anet, het automatiseringsteam van de Universiteit Antwerpen.
Sinds 2004 werken het Rubenianum, het Rubenshuis en het Museum Mayer van den Bergh structureel samen.